หลังจากที่สมาร์ตโฟน Pixel 6 และ 6 Pro ถูกวางขายไป หนึ่งในปัญหาที่พบมากบนสมาร์ตโฟนดังกล่าวคือ ปัญหาเกี่ยวกับเซ็นเซอร์สแกนนิ้วที่อยู่ใต้หน้าจอ โดยปัญหาที่พบล่าสุดคือหากแบตเตอรี่ของตัวสมาร์ตโฟนลดลงเหลือ 0% (แบตหมด) จะทำให้ตัวเครื่องไม่สามารถปลดล็อคได้ด้วยการสแกนลายนิ้วมือ รวมทั้งไม่สามารถเพิ่มลายนิ้วมือใหม่ได้
โดยผู้ใช้งานหลายคนได้พบปัญหาในลักษณะนี้และได้โพสต์ลงบนเว็บไซต์ Reddit แล้ว รวมทั้งได้ทำการรายงานไปยังทาง Google ด้วย อย่างไรก็ดีปัญหาดังกล่าวก็สามารถแก้ไขได้เบื้องต้นโดยการตั้งค่าให้กลับคืนสู่ค่าโรงงาน ซึ่งนอกจากวิธีดังกล่าวจะทำให้เซ็นเซอร์สแกนนิ้วกลับมาใช้งานได้แล้ว ก็ยังสามารถป้องกันไม่ให้เซ็นเซอร์มีปัญหาซ้ำอีกเมื่อแบตเตอรี่หมด
ด้วยเหตุนี้ปัญหาดังกล่าวจึงเป็นปัญหาที่เกี่ยวข้องกับซอร์ฟแวร์ที่สามารถแก้ไขได้ในการอัพเดท firmware ครั้งถัดไป แต่ก่อนจะถึงเวลานั้นผู้ใช้งานสมาร์ตโฟน Pixel 6 และ 6 Pro ควรหลีกเลี่ยงการใช้งานแบตเตอรี่จนหมด เพราะจะทำให้ต้องเสียเวลาแบ็คอัพข้อมูลและล้างเครื่องใหม่ทั้งหมด
ก่อนหน้านี้ได้มีการพบว่าตัวอ่านลายนิ้วมือที่อยู่ใต้หน้าจอนั้นถูกล็อคติดไว้กับเมนบอร์ด ทำให้การเปลี่ยนหน้าจอค่อนข้างยุ่งยากในระดับหนึ่ง นอกจากนั้นการสแกนลายนิ้วมือยังทำงานได้ค่อนข้างช้า ซึ่งทาง Google ได้อ้างว่าเพื่อให้มีความปลลอดภัยมากขึ้น แต่ถึงกระนั้นก็มีผู้ใช้งานที่พบว่าสามารถใช้ลายนิ้วมือของผู้อื่นในการปลดล็อคสมาร์ตโฟนของตัวเองได้ ทำให้สมาร์ตโฟนเรือธงรุ่นล่าสุดของ Google เป็นรุ่นที่ถือว่าค่อนข้างพบปัญหาในการใช้งานมากเลยทีเดียว
